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所有的基因都有调控区,它指令在什么时间,什么条件下,在什么组织中表达该基因。我们也已经看到真核基因调节蛋白可以跨越很长一段DNA发挥作用。那么不同基因的调控区是如何保持彼此互不干扰的呢?换句话说,是什么防止了结合在一个基因调控区的基冈调节蛋白不适当地影响邻近基因的转录呢?

已经提出了许多机制来解释这种区间化,但了解得最清楚的机制依赖于绝缘子元件,也称作边界元件。绝缘子元件(简称绝缘子)是结合特殊蛋白的DNA序列,具有两种特性。首先,它们缓冲了异染色质对基因的抑制作用。如果一个基因(如来自果蝇或者小鼠)及其正常的调控区域插入基因组不同位置,那么根据它在基因组中插入的位点不同,它的表达水平也不同,如果插入到异染色质中,表达水平就特别低。我们见过这种位置效应的一个例子,其中讲到插入到异染色质中的基因都转录沉默了。然而,如果将该基因侧翼的绝缘子及其调控区包括在内,这个基因通常就会正常表达。无论它在基因组中的新位置如何。绝缘子的第二种特性在某种意义上与这一点相反:它们能阻断增强子的作用。要产生这种效应,必须将绝缘子置于增强子和目标基因启动子之间。

因此绝缘子能界定基因表达的区域,既缓冲了基因外部的影响,又阻止了基因(或基因簇)的调控区对该区域外界产生影响。例如,珠蛋白LCR(上面讨论的)与相邻的绝缘子连接起来,该绝缘子使lCR能够只影响这一簇珠蛋白基因。也许另外一个绝缘子位于珠蛋白基因簇的远侧,帮助定义了该区域的另一端。

因此认为绝缘子在基因组中的分布将基因组分割成独立的基因调控区域和染色质结构区域。与这种观点一致的是,绝缘子跨基因组的分布大致与染色质结构中的变化相关。如,果蝇中的一种绝缘子结合蛋白优先定位于多线染色体的间带(以及胀泡的边缘)

目前还不清楚绝缘子的作用机制,可能不同的绝缘子以不同的方式起作用.至少有写绝缘子配对可能界定了成环染色体区域的基础。有人提出所有的真核生物染色体都由绝缘子分割成独立的成环区域,每个都单独受到调节。

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